Agilent质谱在灵敏度表现上十分优异，不同类型的质谱仪均有突出表现：单四级杆质谱在检测痕量有机化合物时，检测限可低至飞克级甚至皮克级；电感耦合等离子体质谱（如Agilent 7900 ICP-MS）低质量数Li(7)灵敏度>50 Mcps/ppm，中质量数Y(89)>160 Mcps/ppm，高质量数Tl(205)>80 Mcps/ppm，检测限低至ppt级；超高压液相色谱-高分辨质谱联用仪对2.5 fmol样品的信噪比≥50:1；气相色谱-离子阱质谱（如Agilent 240-MS）更是被称为灵敏度最高的3-D离子阱质谱，远超单级四极杆质谱。

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