二手蛋白纯化仪价格主要受以下因素影响：

1. 设备的型号与配置：不同型号如AKTA Pure、Explorer、Avant、Start等在功能、流速、压力参数等方面存在差异，配置越高通常价格也越高；
2. 设备的新旧程度：全新设备与二手设备价格差异明显，例如二手AKTA Purifier100蛋白纯化系统参考价在108000元左右；
3. 供应商与销售渠道：不同供应商的报价及销售方式（如拍卖、现货供应等）会对价格产生影响；
4. 是否有国产替代：部分国产替代产品在价格上可能具有一定优势。

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