AKTA蛋白质纯化仪的工作原理主要基于层析技术，通过不同生物分子与固定相的相互作用差异实现分离纯化。其核心原理涵盖多种层析类型：

1. 凝胶过滤（分子筛层析）：利用多孔凝胶介质的“筛分效应”，大分子蛋白无法进入凝胶微孔，沿介质间隙快速流出；小分子蛋白深入微孔，保留时间长，从而按分子量大小分离。
2. 离子交换层析：基于蛋白质表面电荷与固定相介质上相反电荷基团的静电相互作用，通过调整pH值或盐浓度控制结合与洗脱。
3. 疏水作用层析：在高盐条件下，蛋白质疏水区域与固定相疏水基团结合；降低盐浓度时，目标蛋白解脱流出。
4. 亲和层析：依赖目标蛋白与配基（如抗原-抗体、酶-底物）的高特异性结合，通过改变条件选择性洗脱目标蛋白。

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